Vanaf 2006 verzorgt de Bernard Lievegoed School onderwijs voor leerlingen op vmbo-b/k niveau. In 2010 sloten leerlingen voor het eerst de opleiding af met een examen binnen de sector Zorg & Welzijn (breed). Op dit moment wordt samen de inspectie VO onderzocht of de school een intersectoraal programma kan aanbieden en afsluiten met een eindexamen, dat beter aansluit bij de behoeften van de leerlingen èn het karakter van ons kunstzinnig vrijeschoolonderwijs.
Van oudsher wordt er binnen de vrijeschool in de eerste 3 jaar van de opleiding ongedifferentieerd onderwijs in heterogene groepen verzorgd. Dit betekent, dat vmbo-tl leerlingen 3 jaar lang samen met leerlingen met een havo- en vwo-advies het onderwijs volgen. De lessen worden gegeven op havo-niveau, wat het voor leerlingen met een vmbo-advies “pittig” maakt. Toch zien we regelmatig dat leerlingen met een vmbo-advies, met name de slow-starters, door deze 3 “brugjaren” in staat zijn “op te stromen” en in de 10e klas het onderwijs in een havo/vwo klas te volgen.
In het 3e leerjaar (de 9e klas) vindt in 3 stappen de niveau-bepaling plaats. In de 10e klas wordt de vmbo-leerling voorbereid op het vmbo-examen. Tot 2014 is dat het ivo-vmbo-tl examen, dat net als het reguliere vmbo-examen toegang geeft tot MBO-opleidingen. Mocht de leerling alsnog willen doorstromen naar de havo dan is dat mogelijk al zal hij/zij aan specifieke voorwaarden (zie schoolgids) moeten voldoen.